La caficultura del Magdalena posee características particulares que la diferencian de otras regiones del país.
Su situación geográfica, por encontrarse en el extremo norte de Colombia, a 11° de latitud norte, le confiere una oferta ambiental, que obliga a tener plantaciones de café a una altura sobre el nivel del mar menor que en el centro y sur del país. Otro rasgo de la caficultura del Magdalena es la necesidad del uso de árboles de sombrío, actualmente el 93% del área cultivada con café en el departamento cuenta con sombrío total o parcial, como consecuencia de la alta radiación solar que presenta y del pronunciado déficit hídrico que se concentra entre finales de diciembre y principios de abril. Esta situación monomodal del clima produce una floración concentrada en un solo periodo del año (comienzo del periodo lluvioso) produciendo la concentración de una sola cosecha durante los meses de octubre y febrero.
Las características anteriores hacen que el departamento del Magdalena ofrezca condiciones especiales para el desarrollo de programas de “cafés especiales sostenibles”, particularmente de aquellos relacionados con la protección de la biodiversidad y los sistemas de cultivo de cafés ecológicos u orgánicos, Comercio Justo, 4C, Café Practice. Por ello, el departamento cuenta en la actualidad con alrededor de 12.000 has de café certificadas como caficultura sostenible.
Continúa destacándose la siembra de variedades de café resistente a la roya en un 70% con respecto a la caficultura total